Развитие воспалительного процесса в периодонте, наиболее часто возникающего как осложнение пульпита, обусловлено поступлением инфекционно-токсического содержимого корневых каналов через верхушечное отверстие. Этому способствуют чрезмерная жевательная нагрузка на зуб, герметизация полости зуба, пульпа которого некротизирована и др. Инфекционно-токсическое содержимое корневых каналов может проталкиваться эндоканальными инструментами, острие которых выводят за верхушечное отверстие. При этом возникает заболевание периодонтит — наиболее опасное осложнение кариозного процесса. В этом случае воспалительный процесс будет распространяться не только на ткани зуба, но и на костную ткань вокруг верхушек корней зубов. При этом зуб становится подвижным и сильной болит при любом, даже незначительном, касании больного зуба. Температура тела может повышаться. При рассасывании кости вокруг корня, образуется гранулема (мешочек на верхушке корня зуба) или киста (большая полость), которые требуют более серьезного лечения не только из-за сохранения самого зуба, но и для того, чтобы предотвратить отравление организма продуктами распада собственных тканей. При поражении нескольких зубов периодонтитом, у человека развиваются осложнения со стороны внутренних органах.
При лечении периодонтита зуб раскрывают, каналы обрабатывают специальными иглами, антисептиками, ультразвуком. Лечение периодонтита проводят многоэтапно.